目前香菇加工的主要方法有保鲜加工、干制加工、容器加工和其他特殊加工。在保鲜加工中大量的是冷藏保鲜加工,速冻保鲜加工数量很少;干制加工主要是采用烘干机械进行间接烘烤加工,真空干燥香菇产品的比例还较少;容器加工主要有硬质罐头加工和软质罐头加工。
但鲜品的保质期毕竞较短。干制加工是目前香菇产品转化为商品的主要加工形式之一,其加工量大,保质期较长,产品复原性能较好,可提供适应各种对象需求的市场产品。随着软包装的发展容器加工也目前香菇产品转化为商品,可成为即食食品。其他特殊加工包括许多深加工产品的加工方法,如加工休闲食品的减压油炸加工,香菇蜜饯、香菇调味品、香菇复合加工食品、香菇营养保健品的加工、香菇多糖加工等。这些加工对于综合利用香菇原料,提供市场不同层次的需求产品,提高香菇附加值具有重要意义。